Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf21Q9EPU5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms