Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r52Q9EP79 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r52Q9EP79 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r52Q9EP79 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r52Q9EP79 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r52Q9EP79 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r52Q9EP79 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r52Q9EP79 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms