Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aph1cQ9DCZ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms