Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufs3Q9DCT2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms