Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnft1Q9DCN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms