Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med29Q9DB91 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med29Q9DB91 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms