Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Smg9Q9DB90 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Smg9Q9DB90 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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