Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ap1s2Q9DB50 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ap1s2Q9DB50 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms