Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med27Q9DB40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med27Q9DB40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms