Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnn3Q9DAW9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn3Q9DAW9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms