Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc54Q9DAL3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms