Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem239Q9DA47 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms