Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9DA42 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9DA42 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9DA42 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9DA42 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9DA42 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9DA42 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9DA42 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9DA42 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9DA42 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms