Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Samd8Q9DA37 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samd8Q9DA37 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms