Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sgf29Q9DA08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms