Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actrt1Q9D9J3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms