Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldnd2Q9D9H2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd2Q9D9H2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms