Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Speer4bQ9D9F7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4bQ9D9F7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4bQ9D9F7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms