Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntd1Q9D995 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntd1Q9D995 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms