Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs5Q9D920 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Borcs5Q9D920 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms