Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot8Q9D8X5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms