Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx5Q9D8U8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snx5Q9D8U8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms