Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tvp23bQ9D8T4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tvp23bQ9D8T4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms