Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lin37Q9D8N6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lin37Q9D8N6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms