Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc91Q9D8L5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc91Q9D8L5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms