Protein–RNA interactions for Protein: Q9D807

2200002J24Rik, RIKEN cDNA 2200002J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002J24RikQ9D807 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.05■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2200002J24RikQ9D807 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2200002J24RikQ9D807 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms