Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Capn9Q9D805 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn9Q9D805 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms