Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slx4ipQ9D7Y9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slx4ipQ9D7Y9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms