Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Borcs6Q9D6W8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Borcs6Q9D6W8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Borcs6Q9D6W8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms