Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc9bQ9D6E4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc9bQ9D6E4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms