Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptp4a3Q9D658 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms