Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc81Q9D5W4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms