Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lpcat2bQ9D5U0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lpcat2bQ9D5U0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms