Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7Q9D541 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7Q9D541 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7Q9D541 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms