Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf1dQ9D4V4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1dQ9D4V4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms