Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms