Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Phf6Q9D4J7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms