Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcc1Q9D4H2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcc1Q9D4H2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms