Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx11Q9D3G5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Stx11Q9D3G5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms