Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrnp35Q9D384 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snrnp35Q9D384 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrnp35Q9D384 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms