Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trmt44Q9D2Q2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trmt44Q9D2Q2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trmt44Q9D2Q2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms