Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krtap5-3Q9D226 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krtap5-3Q9D226 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms