Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Serpinb3bQ9D1Q5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms