Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec13Q9D1M0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sec13Q9D1M0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sec13Q9D1M0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms