Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd2Q9D1L0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd2Q9D1L0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd2Q9D1L0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd2Q9D1L0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd2Q9D1L0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd2Q9D1L0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms