Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem53Q9D0Z3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem53Q9D0Z3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms