Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdca7Q9D0M2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms