Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2e1Q9D0D5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2e1Q9D0D5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms