Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc47Q9D024 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc47Q9D024 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc47Q9D024 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms