Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc77Q9CZH8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc77Q9CZH8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms